Przy montażu systemu elektrycznego grzania podłogi bardzo istotną kwestią jest programowanie. Oferowane są termostaty zwykłe i adaptacyjne. Sterowniki podstawowe mają manualną nastawę temperatury. Za pośrednictwem pokrętła ustawia się pożądaną temperaturę. Zalecane są do niedużych pomieszczeń w których nie ma konieczności precyzyjnego sterowania temperaturą.
Sterowniki elektroniczne zapewniają dużą precyzję nastawy temperatury. Zawierają cyfrowy wyświetlacz, który umożliwia dokładny odczyt temperatury. Dzięki programowi siedmiodniowemu można nastawić programator na pracę w odpowiednich godzinach w poszczególnych dniach tygodnia. W czasie gdy sensor wykryje spadek temperatury, programator załącza system ogrzewania. Bardzo praktycznym rozwiązaniem, zwłaszcza w kwestii nagrzewania większych płaszczyzn, jest instalacja regulatora z funkcją adaptacyjną. Jego działanie jest podobne do programatora elektronicznego. Dodatkowo jest wyposażony w moduł uczący się bezwładności systemu grzejnego. Po czasie uczenia uruchamia on ogrzewanie odpowiednio wcześniej, aby o odpowiedniej porze temperatura posadzki była zgodna z preferencjami mieszkańców. Jest konieczny jeśli temperatura posadzki jest czasowo obniżana. Gdyż nie trzeba martwić się o czas kolejnego nagrzania podłogi.